O complexo COMCAP oferece suporte à pesquisas análises avançadas distribuídas em 8 oito áreas principais:
Central de Agropastoril e Agronegócios (CAA)
Central de Análise Avançada de Materiais (CAM)
Biologia Molecular, Estrutural e Funcional (CBM)
Central de Documentação (DCO)
Central de Estudo de Mudança Global (CMG)
Central de Microscopia (CMI)
Central de Produtos Naturais (CPN)
Central de Tecnologia em Saúde (CTS)